生物信息学——促动BT与IT双赢

无论是与结构基因组学对应的“基因时代”，还是与功能基因组学、蛋白质组学相应的“后基因时代”；无论你称呼21世纪是“信息时代”、“后信息时代”，还是“生物时代”，所有这一切，都将BT(生物技术)与IT(信息技术)紧密结合起来。而这其中，无疑“生物信息学”占据了天时地利、出尽了风头，虽然它自身及其相关产业蕴涵无限商机，但相对官方，民间资本的介入有待进一步引发。

随着现代科技的发展，生物技术与信息技术的融合成为大势所趋。人类基因组计划及生物信息研究过程中产生的海量数据，需要大容量、高性能、超级计算机的支持。从序列拼接到基因预测，从蛋白结构预测到功能基因的分析，都离不开高性能服务器的支持。

可以预见，超级电脑的高度运算能力将在生命科学、商品开发及企业整合上扮演越来越重要的角色。那些IT巨子们又有了新的“摇钱树”。

我国生物信息学科研后来居上

继提前完成HGP(人类基因组计划)“中国卷”之后，中国科学院、国家计委、科技部“10月12日在京联合宣布，我国科学家克服重重困难，率先在世界上完成了水稻基因组的“工作框架图”和数据库。专家认为，水稻遗传密码的破译，不仅是我国生命科学领域的又一重大突破，也是我国科学家为人类做出的一项重大贡献和基因研究史上的一件大事。

“这一成果由我国科学家独立完成，其意义非比寻常。它标志着我国已经成为继美国之后第二个具有独立完成大规模基因组测序和组装分析能力的国家。”中国科学院基因组生物信息学中心主任杨焕明教授说。

目前世界上已有三个水稻基因组计划。以日本为首包括11个国家和地区科学家参与的“国际水稻基因组协作组”于1997年正式成立，但因种种原因进展不尽如人意。但一些私营基因公司却在此领域后来居上，2000年2月和4月，美国和瑞士的两家私营公司分别宣布完成了他们的水稻基因组“工作框架图”，但他们却不肯公布数据，也不在学术刊物上发表文章，外界对此颇多猜测。

据悉，虽然面临经费短缺等困难，但是我国科学家表示，如果经费及时到位的话，水稻基因组的“完成图”将按计划于明年春节前绘制完成，从而使我国成为世界上第一个完成水稻全基因组序列图的国家。

据悉，作为中国超级杂交水稻基因组计划的主要承担单位之一，中科院人类基因组生物信息学中心暨华大基因中心在1999年申请加入人类基因组计划时，被人类基因组计划协作组以“北京中心”命名，成为“生命登月”计划的16个中心之一。目前，“华大基因”已经成为世界级的生物信息学基地。

与Sun联姻华大“如虎添翼”

由美国Sun(太阳微系统)公司和中科院基因组生物信息学中心暨北京华大基因研究中心联合创办的生物信息学中心10月12日在京宣告成立。这不仅标志着太阳微系统公司这一国际信息产业巨头对我国基因组和生物信息研究的全力支持，更标志着我国基因组与生物信息研究水平迈入国际一流行列。据悉，这是我国首次和国际信息产业巨头在生物信息学领域进行合作。

随着3台Sun服务器的加盟，“华大基因”使用的包括“曙光”在内的主流服务器已经达到7台，成为国内计算实力最强的研究机构之一。据悉，中心挂牌后，SUN公司不仅将提供部分经费予以支持，还将在高性能计算、网络计算和生物信息等方面提供技术支持。

作为国内实力最强大的基因组与生物信息研究机构，北京华大基因研究中心自1999年7月成立伊始，就致力于基因组和生物信息的研究，到今年8月，在国家的大力支持下，和兄弟单位一起出色地绘制出人类基因组“中国卷”。

此外，中心还积极拓展国际合作，在同一舞台上和国际科技界进行平等合作。2000年5月，在提前完成国际人类基因组计划1％项目的“工作框架图”后，华大基因与丹麦农业部共同开展家猪基因组的研究；今年8月，又与美国最大的基因组研究中心结成了姐妹中心。

随着“华人基因”各项研究的逐步开展，高性能计算能力的缺乏，成为其所面临的主要制约因素之一。Sun与华大基因的联姻将推动我国生物信息产业的发展，产生积极而深远的影响。

Sun与康柏双雄逐鹿

实际上早在两个月以前，Sun即宣布北京基因组研究中心(BGI)与德拉威生技研究中心(DBI)获选成为SunCentersofExcellence(COE)。此两个研究中心因其在运算生物学的领导地位，及结合其他机构共同开发生物科技的潜力而获选为SunCOE。DBI所以获选成为高性能运算生物学领域的SunCOE，来自于先进的蛋白质结构、生物路径模拟、电脑侦测序列重复与SNP、以及整体基因组的比较。未来，两个研究中心将正式加入Sun的学术研究机构社群，开发先进技术以从事突破性的研发工作。除了BGI和DBI以外，Sun日前亦已完成在维吉尼亚生技研究中心和威斯康辛麦迪逊大学设立运算生物学COE。

BGI在中国大陆上，已研究基因学和生技中心著称，该中心在基因学、替代接合演算法、以及蛋白质体学方面的先进研究促使其能够获选成为SunCOE。目前，BGI团队成员超过500人，其中200位生物信息学家将藉由两台SunEnterprise10000超级电脑，在北京与杭州进行稻米与猪类基因的研究。

同样，不久之前，康柏电脑也与台湾中央研究院签署合作备忘录，拟集结双方专业经验倾力推动台湾未来生物科技产业之发展，期望继最近20年使台湾活跃于世界舞台的资讯产业后，再度争取台湾在全球生技价值网络中的一席之地，这次与中央研究院的合作，使双方共同成功的加入了CeleraGenomics、英国的SangerCenter、麻塞诸塞州的WhiteheadInstitute、法国的Genoscope及其他许多国际顶尖机构的行列。

日后康柏电脑与中研院是藉由学术交流、创投、策略联盟或是其他模式合作，双方的终极目标便是建立台湾在生物科技所需之基础架构。康柏电脑除了提供台湾的生物科技产业生物资讯学方面的资源之外，还将结合最先进的系统工程专家并且整合过去累积的资源，全力支援研发生物信息学中基因科技所需的高效能运算需求。此外更会积极与国内其他资讯管理和生物科技研究机构策略联盟，提升台湾在此新兴产业中的竞争力。

专利获取风投垂青

虽然官方与民间，科学家与社会学家有关生物信息知识产权存在巨大分析，但无疑专利的实施更能吸引资本的眼球，反过来也促进了生物信息相关产业的发展。在美国便是如此。

因为生物信息学是科学和技术革新的边缘学科。一家生物信息学企业的产品可能是与企业筹备时的原始计划中相差很大或不足所期望的。为了保护可能产生的任何一个和所有产品的所有入的利益，公司需要有全面的和严密的工艺、知识产权。

例如，专利直接保护特殊的基因序列，投机企业收集和分析数据的过程也可以包括在风险投资搭配中。生物信息学是一个持续发展的新领域，这些被保护的过程也可以作为企业的产出。知识产权必须保持先进性，万一有闪失，知识产权会受到侵犯。虽然筹备企业会考虑尽量少的知识产权保护成本，但经验表明筹备企业的知识产权的投入需要经常比基本资产的要多。

为了选择好的投资企业，筹备中的生物信息学企业要把注意力集中在那些生物技术风险投资机构。从这些机构中，来选择那些投资公司会提供理想水平的资金投入，优秀的投资经验和行业联系。对筹备者来说，需要决定潜在企业的投资标准，还有在换得资金后将运行的企业在多大程度上控制它。另一个缩小潜在企业的范围的因素可以称之为支持服务，如媒介，公共关系和广告联系。

最后，生物信息学企业不要为了确保风险投资基金而被那种令人畏缩，快速的竞争性的融资竞赛而灰心丧气。作为互联网企业的后继者和下一波更大的商业进展的预兆，生物技术投资企业期望奸的生物信息学投资机会，他们也愿意改变他们的原则来适应它。

国家筹建“生物信息系统国家研究中心”

据悉，生物信息研究一直是国家计委密切关注和重点支持的重要领域。对中国科学院今后在生物信息学领域的有关研究和科研基础设施建设，国家计委将继续予以支持，并和有关部门一起，共同推进我国生物信息技术的进一步发展，加速产业化。

国家发展计划委员会副主任姜伟新日前介绍，我国将在中国科学院建设“生物信息系统国家研究中心”，形成有国际竞争能力的基因组学、蛋白质组学和生物信息学的整体技术平台。

21世纪是生命科学大发展的时代。以人类基因组计划为序幕的生物信息学研究，是全面认识生命及其过程的重要手段。由此引发的生物信息革命，将从根本上改变生命科学和生物产业的思维方式和研究体系，成为新世纪国际竞争成败的关键之一。