曙光HPC助力中国医学科学院病原生物学研究

服务器
中国医学科学院病原生物学研究所的高性能计算平台采用曙光5000高效能计算机,通过曙光天潮CB60-F刀片服务器、天潮A950r-F、曙光DS6310FE磁盘阵列相配合,实现了物尽其用的原则,最大程度地满足了科研工作对高性能计算能力及存储的需求。

  近日,中国医学科学院病原生物学研究所为了解决对高性能计算的迫切需求,进行了公开招标,中国服务器旗舰厂商曙光公司再次从国内外厂商中脱颖而出成功中标,为中国医学科学院病原生物学研究提供了一个具有高度适应性的高性能平台。中国医学科学院病原生物学研究所的高性能计算平台采用曙光5000高效能计算机,通过曙光天潮CB60-F刀片服务器、天潮A950r-F、曙光DS6310FE磁盘阵列相配合,实现了物尽其用的原则,***程度地满足了科研工作对高性能计算能力及存储的需求。

  中国医学科学院病原生物学研究所高性能计算平台工程于2009年2月招标,由于涉及病原生物学研究及相关应用,因此从技术要求、安全性等多个方面都对曙光提出了挑战。应标之初,曙光就充分考虑到了以上因素,在方案的设计上,采用目前业界主流Intel xeon 双路四核刀片和8路SMP共享内存小机,在7U空间里可容纳80个计算核心,总体计算核心数为288个。同时,迅速确立了高密度,高效能,先进性,高可用可靠性,可扩展性,高应用性,低功耗的七大原则,以满足研究所的需求。

  曙光5000是曙光公司2008年推出的高效能计算机产品平台,其中的曙光5000A百万亿次超级计算机在最近的一次全球超级计算机TOP500排行榜中进入前十,成为美国以外全世界运算速度最快的高性能计算机。作为高性能计算领导厂商,曙光面向科研领域,以高校高性能应用为特色,为中国医学科学院病原生物学研究所量身定制了一个高性能计算与应用服务平台。在这个平台上,曙光TC2600刀片服务器作为曙光公司研发的第三代双核/四核刀片服务器产品,在众多方面超越了传统机架式服务器,是高稳定、高可用、高扩展、高密度、高性能的新一代服务器产品。它推动服务器向更高计算密度、更多集成功能和更强管理能力的方向发展,提供更加卓越的计算处理性能、简单方便的部署使用和全方位的监控管理,可以显著提高数据中心和高性能计算中心的生产率和工作效率,***限度地降低IT运营和管理维护成本。它采用整体优化的策略,有效降低了系统功耗,再加上其人性化的设计、超强的系统扩展能力、卓越的性价比和计算密度,可以覆盖更广泛的需求。基于TC2600的曙光5000高效能计算机完全可以满足研究所科研团队对于高性能计算能力的渴求以及对数据存储安全的担忧,是科研院所超算中心的理想平台。

  曙光公司与中国医学科学院病原生物学研究所共同打造的曙光5000“超算”平台,还特意针对用户对存储要求进行了方案规划。长期以来,研究所科研团队对如何解决无限增长的数据集中存储和处理一直感到困扰。曙光公司除了为用户提供包括CB60r-F刀片集群系统外,还提供了曙光A950r-F作为管理节点、曙光DS6310FE磁盘阵列作为存储系统。天阔 A950r-F 服务器***支持8颗AMD Opteron 8000系列处理器,4X512KB二级缓存,6MB共享三级缓存,采用Nvidia高性能芯片组,支持HyperTransport连接,支持 64位内存扩展技术,可大大提高应用程序的运行效率;支持DDR2 533/667内存,32个DIMM插槽,***可支持128GB内存,强大的内存带宽,可轻松应对大规模计算过程中的海量数据交换,是服务器高计算性能的保证;可选PCI-E ×16高端图行卡,支持SLI功能,支持高速扩展设备;内存***可扩展至 128G,可配合高性能 RAID卡实现超高磁盘I/O性能。天阔A950r-F与曙光DS6310FE共同搭建的存储系统,具有海量存储、高性能、高可用、易扩展、易管理等特点,负责与数据中心的各应用服务器、全局分发和传输服务器以及核心交换机等设备高速连接和与存储相关设备连接集成。

  曙光公司始终专注于服务器领域的研发、生产与应用,依托超级计算机的扎实功底,生产出一批拥有完全自主知识产权的全系列精品服务器,目前曙光是国内服务器产品线最全的厂商。这次曙光中标中国医学科学院病原生物学研究所新系统的高性能计算机,带来的不仅是运行效率的显著提升,同时也完全满足了用户对更高计算性能和更低成本的追求,让用户在***程度上感受到高性能计算技术的真实价值,从而实现稳定、高品质的服务,也将在更深层次上推动我国科研领域高性能计算系统的建设,让中国的科学研究事业发展在高性能计算平台上扬帆起航。

责任编辑:常疆 来源: 51cto.com
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